Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM4AO75164 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms