Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL13O43927 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms