Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms