Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF5O00463 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms