Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01387J3KSC0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms