Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCRIP1C9JLW8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCRIP1C9JLW8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms