Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PATL2C9JE40 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms