Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC4A6NH21 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERINC4A6NH21 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms