Protein–RNA interactions for Protein: A2A3L6

TTC24, Tetratricopeptide repeat protein 24, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC24A2A3L6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTC24A2A3L6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTC24A2A3L6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms