Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPDC1A2A3K4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPDC1A2A3K4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms