Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0D9SFI3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms