Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC61Q9Y6R9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC61Q9Y6R9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms