Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRRAPQ9Y4A5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRRAPQ9Y4A5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms