Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIF3AQ9Y496 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KIF3AQ9Y496 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms