Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms