Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMC3Q9UQE7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC3Q9UQE7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms