Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHIC2Q9UKJ5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CHIC2Q9UKJ5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms