Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBE1Q9UJT0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBE1Q9UJT0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms