Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPN3Q9UHW5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms