Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2IRD1Q9UHL9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms