Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTNAP2Q9UHC6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms