Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTNNAL1Q9UBT7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms