Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
USP35Q9P2H5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms