Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC10Q9NYD6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms