Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DDX43Q9NXZ2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDX43Q9NXZ2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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