Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF3Q9NR23 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms