Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INCENPQ9NQS7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
INCENPQ9NQS7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
INCENPQ9NQS7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
INCENPQ9NQS7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
INCENPQ9NQS7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
INCENPQ9NQS7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
INCENPQ9NQS7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
INCENPQ9NQS7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
INCENPQ9NQS7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
INCENPQ9NQS7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
INCENPQ9NQS7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
INCENPQ9NQS7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
INCENPQ9NQS7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
INCENPQ9NQS7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.8 ms