Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMB3Q9NPA1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMB3Q9NPA1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMB3Q9NPA1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMB3Q9NPA1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMB3Q9NPA1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMB3Q9NPA1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMB3Q9NPA1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNMB3Q9NPA1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms