Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUFT1Q9NNX1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUFT1Q9NNX1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms