Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VAT1LQ9HCJ6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAT1LQ9HCJ6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms