Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NBPF3Q9H094 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NBPF3Q9H094 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms