Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP4-3Q9BYR4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms