Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHANK3Q9BYB0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHANK3Q9BYB0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms