Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DUSP9Q99956 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms