Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF396Q96N95 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF396Q96N95 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms