Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC43Q96MW1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC43Q96MW1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms