Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC138Q96M89 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms