Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP47Q96K76 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms