Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC11Q96J66 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC11Q96J66 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC11Q96J66 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC11Q96J66 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC11Q96J66 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC11Q96J66 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC11Q96J66 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC11Q96J66 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC11Q96J66 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC11Q96J66 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC11Q96J66 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC11Q96J66 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC11Q96J66 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC11Q96J66 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC11Q96J66 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC11Q96J66 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC11Q96J66 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC11Q96J66 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC11Q96J66 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC11Q96J66 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC11Q96J66 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC11Q96J66 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC11Q96J66 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC11Q96J66 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC11Q96J66 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC11Q96J66 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC11Q96J66 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC11Q96J66 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC11Q96J66 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms