Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms