Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC47Q96A33 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC47Q96A33 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms