Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CAVIN3Q969G5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CAVIN3Q969G5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms