Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms