Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC4Q92889 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms