Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHIPQ8WWQ0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHIPQ8WWQ0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHIPQ8WWQ0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHIPQ8WWQ0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHIPQ8WWQ0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHIPQ8WWQ0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHIPQ8WWQ0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHIPQ8WWQ0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHIPQ8WWQ0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHIPQ8WWQ0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHIPQ8WWQ0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHIPQ8WWQ0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHIPQ8WWQ0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHIPQ8WWQ0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHIPQ8WWQ0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PHIPQ8WWQ0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHIPQ8WWQ0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHIPQ8WWQ0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHIPQ8WWQ0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHIPQ8WWQ0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms