Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRIM41Q8WV44 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
TRIM41Q8WV44 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms