Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM35BQ8NCS4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM35BQ8NCS4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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