Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM87AQ8NBN3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM87AQ8NBN3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM87AQ8NBN3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM87AQ8NBN3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM87AQ8NBN3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM87AQ8NBN3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM87AQ8NBN3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM87AQ8NBN3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM87AQ8NBN3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM87AQ8NBN3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM87AQ8NBN3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM87AQ8NBN3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM87AQ8NBN3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM87AQ8NBN3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM87AQ8NBN3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM87AQ8NBN3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms