Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYT2Q8N9I0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT2Q8N9I0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms