Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms